Она сохранилась в 50-тысячелетнем зубе редунки
Палеогенетики секвенировали древнейшую ДНК из образца, найденного в Африке. Она сохранилась в зубе, который принадлежал горному редунке, обитавшему на юге континента приблизительно 50 тысяч лет назад. Об этом ученые пишут в статье, опубликованной в журнале Quaternary Science Reviews.
За последние полтора десятилетия палеобиологи добились огромного прогресса в секвенировании и анализе ДНК, сохранившейся в останках древних людей и животных. Поэтому неудивительно, что успехи в этой области принесли в 2022 году Сванте Паабо (Svante Pääbo) Нобелевскую премию по физиологии и медицине, о чем подробно можно прочитать в нашем материале «Человек, который собрал древних». Исследования показали, что в благоприятных условиях (в многолетней мерзлоте) ДНК может сохраняться больше миллиона лет.
Однако в регионах с жарким климатом молекулы ДНК, как правило, разрушаются быстро. По этой причине до сих пор известно крайне мало древних геномов из Африки, возраст которых превышал бы десять тысяч лет. Например, ученые прочитали ДНК нескольких человек из Северной Африки, которые жили примерно 15–14 тысяч лет назад. Кроме того, в 2024 году исследователи опубликовали древнейший геном из Южной Африки — он принадлежал индивиду, которых умер приблизительно десять тысяч лет назад.
Теперь группа ученых из Дании, Канады, США и ЮАР во главе с Элин Лоренцен (Eline Lorenzen) из Копенгагенского университета решила проверить, как часто и насколько хорошо может сохраниться эндогенная ДНК и коллаген в костях и зубах диких животных, раскопанных в шести местонахождениях, которые расположены в Южной Африке. В общей сложности они отобрали 320 образцов, которые, по данным палеонтологов, относились к шести видам полорогих, которые жили в позднем плейстоцене и голоцене. Возраст самого древнего образца составлял около 110 тысяч лет.
Сохранность ДНК исследователи проверили в 144 образцах и обнаружили, что в 65 случаях ее было достаточно для того, чтобы определить видовой статус животного, которому принадлежал зуб или кость. В 62 из 65 случаев палеогенетики подтвердили определения палеонтологов, касающиеся вида или рода животного. Но в двух случаях кости, приписанные первоначально редункам (Redunca sp.), на самом деле принадлежали косульим антилопам (Pelea capreolus). Еще один образец представлял собой зуб из пещеры Бумплаас. Палеонтологи считали, что он принадлежал большому редунке (R. arundinum), но палеогенетики заключили, что это остатки горного редунки (R. fulvorufula).
Последний образец представляет большой интерес, поскольку, по данным ученых, его минимальный возраст составляет 50 тысяч лет, то есть это древнейший на сегодняшний день африканский геном. Помимо него, исследователи успешно секвенировали ДНК еще из трех находок, относящихся к позднему плейстоцену. Они представляли собой зубы вымерших буйволов Syncerus antiquus, обнаруженные в пещере Нельсон-Бей. Возраст двух из них ученые оценили в 21–23,5 тысячи лет, а еще одного — в 12–14,1 тысячи лет. Оставшийся 61 образец с сохранившейся ДНК относился к эпохе голоцена, то есть их возраст меньше 11,7 тысячи лет (в среднем — 3,1 тысячи лет).
Недавние исследования показали, что в редких случаях в находках, относящихся к эпохе плейстоцена, может сохраниться не только ДНК, но и РНК. Древнейшую РНК ученые секвенировали из мумифицированных тканей мамонтенка Юки, который умер на территории современной Якутии приблизительно 40 тысяч лет назад.